聯鎖 (Interlocking) 系統理論上會避免衝突（特別是道岔範圍），以往靠機械式裝置，以人手扳動（現時外國仍有些大鐵用這些傳統系統），有衝突的話，操作員不會拉得動那些桿。後來發展到用繼電器聯鎖 （Relay Interlocking），利用電路避免衝突，有圖紙跟，同樣不是個黑箱。

科技日新月異，現時這些東西都漸漸遭淘汰，而改為用電腦聯鎖（簡稱為 CBI)，背後就如你所言看軟體邏輯了，但其實 CBI 都用了很多年了，而並非只有使用 Moving Block系統才用 CBI，例如藍田站一帶早就採用了 SSI (solid-state interlocking，看成 CBI 早期的名稱吧)。Anyway, 究竟今次 root cause 係咩真的只能留待後續調查，只能夠說實在唔尋常。

Btw，其實依家車長都應該已經幾悶，大部份系統都有ATO (automatic train operation)，好彩閂到門的話，撳個掣就自動行到下一個站。